全身性的關節疼痛的治療主要是針對病因對症治療。首先最常見的是勞累、疾病、藥物等引起的疼痛，在青年人中多是由於勞累及疾病引起，比如感冒、關節炎、長時間加班熬夜等，建議應該注意休息，積極治療感染性疾病，多注意保暖，加強營養；藥物引起的全身關節痠痛建議可以暫時停止服用相關藥物，待病情穩定後再繼續治療。

骨質疏鬆也會引起全身關節疼痛，主要見於老年人，尤其是絕經後的女性，建議應該抗骨質疏鬆治療，適當補充鈣劑，多活動身體，合併有關節炎症的，應該及時抗炎治療。

全身性關節疼痛可以由風溼免疫性疾病導致，比如風溼性關節炎，這類疾病建議可以使用免疫功能調節制劑，嚴重的患者可以服用非甾體類消炎止痛藥。痛風引起的關節炎可以服用小蘇打鹼化尿液，並注意飲食清淡，避免大量食用豆製品、海鮮、動物內臟等蛋白質嘌呤含量較高的食物，少喝啤酒。