甲狀腺全切除術，是指切除兩側甲狀腺腺體以及峽部，甲狀腺次全切除術一般需要切除腺體的90%左右。甲狀腺全切除術後，甲狀腺功能喪失，需要額外補充甲狀腺激素，甲狀腺次全切除術後，經過一段時間殘餘甲狀腺會逐漸恢復部分功能。甲狀腺全切除術，是指切除兩側甲狀腺腺體以及峽部，往往用於雙側甲狀腺癌，或單側甲狀腺多發癌，以及單側濾泡狀癌或髓樣癌以及未分化癌。

對於甲狀腺次全切除術多用於保守治療無效的甲亢患者，切除腺體的多少，需要根據按病人甲亢症狀程度而定，一般需要切除腺體的90%左右，也就是在每側甲狀腺上級殘留腺體約一拇指末節大小的甲狀腺組織，以保護甲狀旁腺及喉返神經，術後也足以維持正常生理功能，又不易導致復發，對於結節性甲狀腺腫的病人，則應該適當地多保留一些甲狀腺組織。甲狀腺全切除術後，甲狀腺功能喪失，需要額外補充甲狀腺激素，通常選用優甲樂，甲狀腺次全切除術後，短時間內會導致功能不足，但經過一段時間代償，殘餘甲狀腺會逐漸恢復部分功能，可以滿足機體代謝需要，因此僅需要服用優甲樂3個月到半年左右，期間要定期複查甲功，並及時地調整左甲狀腺素鈉片劑量。